Segundo um documento fornecido pela educadora Sara Bettencourt, esta instituição teve início no ano 1898 com o nome de Colégio de Santa Clara, que encerrou com a Implantação da República em 1910. Reiniciou as suas funcões no dia 3 de Maio de 1929 com um grupo de sessenta crianças dos 2 aos 6 anos de idade, ao cuidado das Irmãs Franciscanas Missionárias de Maria, intitulada “Creche de Santa Clara”. Em 1932 passou também a possuir "Escola Primária" com crianças dos 7 aos 12 anos, cujo Alvará reconhecido pelo Ministério de Educação. Em 1973 foi encerrada esta valência.

       No ano de 1991 foi reconhecida oficialmente, com registo definitivo, por "Obra Social das Franciscanas Missionárias de Maria Semi-Internato de Santa Clara”. Sendo uma Instituição Particular de Solidariedade Social com personalidade jurídica. Criada por iniciativa da província Portuguesa do Instituto das Franciscanas Missionárias de Maria, cuja sede estabeleceu-se na Rua Chaby pinheiro, 12 A, Lisboa. Sem quaisquer fins lucrativos, para além dos fins estritamente religiosos prossegue fins de solidariedade social.

       “O Infantário Semi-Internato de Santa Clara” actualmente fica situado na freguesia de S.Pedro- Cidade do Funchal. Funciona no Convento de Santa Clara, edifício pertencente aos Monumentos Nacionais. Está integrado na Obra Social dos Franciscanas Missionárias de Maria e tem como objetivo geral educar a criança no amor para a liberdade responsável, criativa e participativa, à luz dos valores humano-cristãos incentivando-a a ser, segundo o documento que rege as atividades desta instituição:

     - Artífice do seu processo de desenvolvimento integral

    - Agente de transformação duma sociedade que queremos construída na verdade na justiça, na solidariedade e na fraternidade

     - Sujeito promotor de relações consigo própria, com os outros e com Deus

       É frequentada, atualmente, por 168 crianças com idades compreendidas entre os 4 meses e os 6 anos.

       Organiza-se em comunidade educativa com todos os adultos que trabalham na instituição abrangendo crianças, pais e meio envolvente, numa dinâmica de participação co-responsável e criativa.